技術(shù)服務(wù)描述

 CHIRP(Chromatin Isolation by RNA Purification)是一種檢測與RNA綁定的DNA和蛋白相互作用的方法，可同時(shí)分析lncRNA/circRNA 、蛋白及DNA三者互作關(guān)系。利用ChIRP-seq技術(shù)可用于在全基因范圍內定位lncRNA/circRNA的結合位點(diǎn)和可能結合的其他RNA分子,是揭示位于細胞核內lncRNA/circRNA 生物學(xué)機制的關(guān)鍵實(shí)驗手段。該方法是通過(guò)設計與目標RNA序列反向互補的生物素探針，把目標RNA拉下來(lái)以后，與其共同作用的DNA染色體片段就會(huì )附到鏈霉親和素磁珠上，最后通過(guò)qRT-PCR或測序來(lái)測定目的RNA、DNA序列，亦或是通過(guò)Western或質(zhì)譜分析來(lái)測定蛋白。

服務(wù)優(yōu)勢：

（1）、CHIRP實(shí)驗可研究細胞體內互作；

（2）、CHIRP實(shí)驗既同時(shí)可研究RNA、蛋白質(zhì)和DNA形成的復合體之間的互作；也可研究它們之間的兩兩互作；

（3）、利用CHIRP-MS實(shí)驗尋找與目的lncRNA結合的蛋白，可不受lncRNA長(cháng)度的限制；

（4）、利用CHIRP實(shí)驗可研究circRNA與蛋白質(zhì)或DNA之間的互作。

服務(wù)內容：

可用于研究RNA與DNA互作

可用于研究RNA與蛋白互作

可用于研究DNA與蛋白互作

服務(wù)流程：

（1）、CHIRP-RNA：探針設計與合成→細胞交聯(lián)→細胞裂解、超聲處理→探針雜交→復合物純化→RNA回收與純化→NGS或qRT-PCR檢測；

（2）、CHIRP-DNA：探針設計與合成→細胞交聯(lián)→細胞裂解、超聲處理→探針雜交→復合物純化→DNA回收與純化→NGS或qPCR檢測；

（3）、CHIRP-Protein：探針設計與合成→細胞交聯(lián)→細胞裂解、超聲處理→探針雜交→復合物純化→蛋白分離→質(zhì)譜鑒定。

客戶(hù)提供：

需要研究的RNA、DNA或蛋白名稱(chēng)及序列

所研究的細胞

我們提供：

實(shí)驗報告（材料、試劑、儀器、方法、數據分析、實(shí)驗結果）。

其他注意事項：

1、目標lncRNA/circRNA的表達豐度：

2、如果目標lncRNA/circRNA表達豐度較低，需要進(jìn)行過(guò)表達以確保ChIRP成功；